Doch Jonathan Frakes überzeugte nicht nur vor der Kamera. Als Regisseur inszenierte er zahlreiche Folgen verschiedener Star Trek-Serien und führte bei den Kinofilmen Star Trek: Der erste Kontakt und Star Trek: Der Aufstand Regie. Auch außerhalb des Franchise machte er sich einen Namen und inszenierte unter anderem Clockstoppers, Thunderbirds sowie zahlreiche Episoden von Serien wie The Orville, Roswell, Leverage, Castle und Marvel’s Agents of S.H.I.E.L.D.
Im phantastischen Genre war Jonathan Frakes außerdem in Produktionen wie Gargoyles – Auf den Schwingen der Gerechtigkeit als Sprecher sowie in Gastrollen unter anderem in Roswell und The Librarians zu erleben. Seit Jahrzehnten begeistert er mit seinem Charisma, seinem Humor und seiner Nähe zu den Fans – beste Voraussetzungen also für ein Wiedersehen auf der FedCon 35, auf das sich zahlreiche Trekkies schon jetzt freuen dürfen.
